Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18527 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18527 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18527 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18527 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18527 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18527 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18527 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18527 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18527 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18527 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18527 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms