Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18526 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18526 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18526 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18526 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18526 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18526 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms