Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxb1P17919 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms