Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FosbP13346 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FosbP13346 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FosbP13346 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FosbP13346 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FosbP13346 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FosbP13346 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FosbP13346 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FosbP13346 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FosbP13346 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FosbP13346 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FosbP13346 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FosbP13346 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FosbP13346 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FosbP13346 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FosbP13346 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FosbP13346 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms