Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lamp1P11438 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lamp1P11438 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms