Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd8bP10300 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms