Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igsf6P0C6B7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms