Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc9P09633 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms