Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms