Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TtrP07309 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TtrP07309 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtrP07309 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtrP07309 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtrP07309 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtrP07309 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TtrP07309 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtrP07309 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtrP07309 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtrP07309 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtrP07309 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtrP07309 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TtrP07309 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtrP07309 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtrP07309 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TtrP07309 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtrP07309 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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