Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P06335 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P06335 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06335 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06335 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06335 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P06335 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P06335 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P06335 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P06335 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms