Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh1P04444 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh1P04444 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh1P04444 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh1P04444 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-bh1P04444 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms