Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt1P04104 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms