Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01678 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01678 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01678 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01678 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01678 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01678 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01678 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01678 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01678 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01678 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01678 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01678 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01678 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01678 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01678 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01678 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms