Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abl1P00520 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abl1P00520 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms