Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casp8O89110 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casp8O89110 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms