Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apaf1O88879 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms