Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx4O55187 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms