Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlkO54988 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlkO54988 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlkO54988 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SlkO54988 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlkO54988 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlkO54988 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlkO54988 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlkO54988 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlkO54988 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlkO54988 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlkO54988 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SlkO54988 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SlkO54988 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SlkO54988 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SlkO54988 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SlkO54988 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SlkO54988 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SlkO54988 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SlkO54988 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SlkO54988 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SlkO54988 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SlkO54988 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SlkO54988 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlkO54988 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SlkO54988 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms