Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccl25O35903 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ccl25O35903 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccl25O35903 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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