Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sp100O35892 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sp100O35892 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms