Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cited2O35740 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms