Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stag2O35638 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag2O35638 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Stag2O35638 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms