Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppef2O35385 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms