Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kpna3O35344 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms