Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcshO08795 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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