Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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