Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm8050L7N2E3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8050L7N2E3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms