Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IfnabL7MTU6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms