Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9602J3QPD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9602J3QPD5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms