Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm3099J3QPA5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms