Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E030018B13RikJ3QMS9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms