Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc179J3QM76 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms