Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20825J3QM67 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20825J3QM67 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20825J3QM67 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20825J3QM67 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20825J3QM67 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20825J3QM67 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm20825J3QM67 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm20825J3QM67 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20825J3QM67 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20825J3QM67 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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