Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3727J3QM54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm3727J3QM54 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm3727J3QM54 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm3727J3QM54 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm3727J3QM54 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm3727J3QM54 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm3727J3QM54 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3727J3QM54 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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