Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21244J3QK38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm21244J3QK38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms