Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20830J3KML6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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