Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20828J3KMI7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Gm20828J3KMI7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20828J3KMI7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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