Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm29394H3BIW7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm29394H3BIW7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms