Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r58G3X9U3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms