Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zkscan2G3X952 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zkscan2G3X952 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan2G3X952 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms