Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srp72F8VQC1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms