Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp9yF8VPU6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usp9yF8VPU6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usp9yF8VPU6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9yF8VPU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9yF8VPU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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