Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4933403O08RikF6UK53 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms