Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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H2-M11F6U8V3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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H2-M11F6U8V3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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H2-M11F6U8V3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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H2-M11F6U8V3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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H2-M11F6U8V3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M11F6U8V3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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H2-M11F6U8V3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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H2-M11F6U8V3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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H2-M11F6U8V3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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H2-M11F6U8V3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M11F6U8V3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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H2-M11F6U8V3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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