Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc74aE9Q9U8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms