Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc146E9Q9F7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms