Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mcmdc2E9Q956 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcmdc2E9Q956 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms