Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Gm5407E9Q7Q1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm5407E9Q7Q1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm5407E9Q7Q1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm5407E9Q7Q1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm5407E9Q7Q1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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Gm5407E9Q7Q1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5407E9Q7Q1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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