Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb9E9Q5G2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms